Banzragch M, Sanli K, Stensvold CR, Kurt O, Ari S.Scand J Gastroenterol. 2023 Jul-Dec;58(11):1253-1263. doi: 10.1080/00365521.2023.2223708. Epub 2023 Jun 20.
Kolon temizleme sıvısının metabar kodlaması, İnflamatuar Bağırsak Hastalığı ile ilişkili mukozal mikrobiyotanın benzersiz bakteriyel üyelerini ortaya çıkarır
Özet
Arkaplan: İnflamatuar Bağırsak Hastalığı (İBH), bağırsak mikrobiyotasının disbiyozisi ile ilişkili gastrointestinal (GI) sistemin bir grup kronik idiyopatik inflamatuar hastalığıdır. IBD hastalarının bağırsak mikrobiyotasının metabarkodlamaya dayalı profili, genellikle mukoza ile ilişkili mikrobiyotayı nadiren temsil eden bireysel hastalardan toplanan dışkı örneklerine dayanır. İBH’nın mukozal bileşeninin rutin olarak izlenmesi için ideal örnekleme stratejisi henüz belirlenmemiştir.
Yöntemler: Burada kolonoskopi sırasında toplanan kolonik temizleme sıvısının (CCF) mikrobiyota kompozisyonunu İBH hastalarından alınan dışkı örnekleriyle karşılaştırdık. IBD ile bağırsak mikrobiyotası arasındaki ilişki, 16S rRNA amplikon dizilimine dayalı metabar kodlama yaklaşımının uygulanmasıyla ortaya çıkarıldı. Crohn hastalığı ve ülseratif koliti olan İBH hastalarından CCF ve dışkı örnekleri toplandı.
Bulgular: Bu çalışma, CCF örneklerinin mikrobiyal bileşiminde önemli farklılıklar göstermektedir; bu, muhtemelen kontrol grubuyla karşılaştırıldığında IBD hastalarının mukozal mikrobiyotasındaki değişiklikleri gösterir. Lachnospiraceae familyası altında kısa zincirli yağ asidi üreten bakteriler , aktinobakteriyel cins Bifidobacterium , proteobakteriyel Sutterella ve Raoultella’nın İBH hastalarında mukozal floranın mikrobiyal disbiyozuna katkıda bulunduğu bulunmuştur.
Sonuçlar: CCF mikrobiyotası, İBH hastalarını sağlıklı kontrollerden ayırma kapasitesine sahiptir ve bu nedenle İBH biyobelirteç araştırmalarında erken tanı ve hastalığın ilerlemesi için alternatif bir analiz stratejisi oluşturabilir.
Anahtar Kelimeler: 16S rRNA metabar kodlaması; kolonik temizleme sıvısı; bağırsak mikrobiyotresi; enflamatuar barsak hastalığı; metagenomik.
Uzman Dr. Mutse YAĞCI
2004 Ege Üniversitesi Tıp Fakültesi mezunudur. 2010 yılında İstanbul Tıp Fakültesi'nden Dahiliye ihtisasını, 2011-2014 yılları arasında Marmara Üniversitesi'nde Gastroenteroloji yan dal uzmanlık eğitimini tamamlamıştır. İlgi alanları ESD, EMR, POEM, ERCP, EUS, PH metre, Anal manometre, Özofagus manometre. PATH Barcelona, EASL, İBH ve Türk Karaciğer Araştırmalar Derneği üyesidir.